آموزش PCR و طراحی پرایمر با نرم افزار GENE RUNNER
معرفی دوره + گزیده دروس (ورق بزنید)
اطلاعات آموزش
مدت زمان آموزش:
4 ساعت و 14 دقیقه
حجم دانلود:
411 مگابایت
زبان:
فارسی
رشته های مرتبط:
مهندسی شیمی، پزشکی، آزمایشگاه
149500 تومان
به طور خلاصه آنچه فرا می گیرید...
این دوره آموزشی به منظور طراحی پرایمر توسط نرم افزار Gene Runner برای PCR ارائه می شود، ضمن آموزش کار با نرم افزار Gene Runner به مواردی چون تئوری پرایمر و جست و جوی توالی مورد نظر در سایت NCBI و به بررسی صحت پرایمر طراحی شده می پردازد . با استفاده از نرم افزار I-mutant جهش اعمال شده برای بهبود یافتن محصول آموزش داده می شود و کلیات PCR و اجزای واکنش PCR و معرفی برخی از انواع PCR و کاربردهای آن و حل مشکلات مرتبط با PCR شرح داده می شود .
کد آموزش:
DV-GNR-1113
سطح:
مقدماتی تا متوسط
کیفیت:
HD 16:9
شناسه وزارت ارشاد:
8-34305-0655000
محتوای بسته
آموزش ویدیویی تایید شده
یادداشت های مدرس
پشتیبانی 24 ساعته
فایل ها و پروژه های تدریس شده
فعال سازی آنی لینک دانلود
کیفیت تضمین شده
درسواره ناشر رسمی محتوای آموزشی دیجیتالی از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی است.
توضیحات
طراحی پرایمر یکی از مباحث فوق‌العاده با اهمیت در مباحث مولکولی می‌باشد، طراحی پرایمر در شناسایی ژن هدف، تشخیص بیماری‌ها و سرطان، تشخیص ژن ویروس و ژن کلون شده، فعالیت‌های تحقیقاتی آنکولوژی و فعالیت‌های مهندسی ژنتیک و بیوتکنولوژی و ژنتیک پزشکی مولکولی و… کاربرد دارد. آموزش PCR و طراحی پرایمر با نرم افزار GENE RUNNER به منظور شرح شیوه طراحی پرایمر خدمت شما مخاطبین درسواره ارائه شده است.
علت اهمیت طراحی پرایمر به خاطر تاثیر زیاد در موفقیت تکنیک PCR و Real – Time می باشد. با انجام طراحی پرایمر و مطالعه بیوانفورماتیکی توالی‌یابی‌های انجام شده بر روی بیماری‌های مختلف می‌توان کمک بزرگی در تشخیص این بیماری‌ها و جلوگیری از پیشرفت بیماری و مطالعه و بررسی پاتولوژیکی بعدی به منظور کنترل بیماری‌ها انجام داد.
طراحی نامناسب پرایمر باعث می‌شود که قطعه مورد نظر ما در PCR یا تکثیر نشود یا خیلی کم تکثیر شود و از طرفی می‌تواند منجر به تولید غیر اختصاصی محصولات PCR شود. به همین منظور برای طراحی پرایمر باید دقت کافی رو داشته باشیم.
Gene Runner یک برنامه تجزیه و تحلیل توالی DNA با محیط کاری آسان برای استفاده است. این برنامه حاشیه‌نویسی‌های مفیدی را در مورد یک دنباله با ویژگی های مختلف ارائه می‌دهد، حاشیه‌نویسی ویژگی‌ها نشان دهنده مکان ویژگی‌ها در دنباله‌ای است که توسط آزمایش یا تجزیه و تحلیل رایانه تعیین شده است. مکان یک ویژگی ممکن است بسیار ساده باشد، یک پایه یا محدوده پایه، یا پیوند‌های دامنه پایه بسیار پیچیده در چندین توالی مختلف پخش شود. اگر شما هم علاقمند به یادگیری این نرم افزار و نحوه طراحی پرامیر هستید با آموزش PCR و طراحی پرایمر با نرم افزار GENE RUNNER ما را همراهی کنید.
سرفصل ها
- درس اول: واکنش زنجیره ای پلیمراز یا PCR
- تاریخچه PCR
- مراحل اصلی PCR
- دستگاه ترموسایکلر
- نحوه اجرای واکنش PCR
- اجزای مورد نیاز واکنش PCR
- نحوه شناسایی قطعات تکثیر شده در PCR
- درس دوم : انواع تغییریافته PCR
- تفاوت PCR و کلونینگ
- PCR رونویسی معکوس یا RT_ PCR
- PCR آشیانه ایی یا Nested PCR
- PCR چندگانه یا مولتیپلکس PCR
- Real-time PCR
- PCR نامتقارن یا Asymmetric PCR
- PCR های هم دما یا isothermal
- Hot – start PCR
- ARMS PCR
- RFLP – PCR
- RACE – PCR
- Touchdown PCR
- کاربردهای PCR
- مزایا و معایب PCR
- درس سوم : مبانی طراحی پرایمر
- آموزش کامل پرایمر
- ساختارهای ثانویه
- شرایط پرایمرایده آل درPCR
- دمای ذوب پرایمر یاTM
- دمای اتصل پرایمر یا Ta
- درس چهارم : سایت NCBI
- NCBI
- All databases
- نحوه پیدا کردن توالی ژنی و نوکلئوتیدی
- FASTA
- نحوه پیدا کردن توالی پروتئینی
- فایل PDB وساختارهای پروتئینی
- uniprot
- درس پنجم : طراحی پرایمر با نرم افزارGene Runner و جهش ایجاد شده به کمک نرم افزار
- نرم افزار Gene Runner
- نحوه قرارگیری توالی در نرم افزار
- تنظیمات پنل PCR Primer design
- بررسی پرایمر با oligo sequence
- Blast کردن پرایمرها
- طراحی عملی پرایمر
- بررسی جهش توسط نرم افزار I-mutant
- نحوه پیدا کردن اسیدآمینه خاص
- درس ششم : مشکلات PCR و روش های رفع خطا
- مشکلات PCR
- عدم مشاهده باد یا وجود باند ضعیف
- مشاهده باند اضافی
- کنترل مثبت و کنترل منفی در PCR
- مثبت کاذب و منفی کاذب
- مهارکننده های PCR
- روش های حذف مهارکننده های PCR
دیدگاه کاربران
اشتراک
